Trang: 19
Tập 28, số 4 2018
Đột biến gen embB gây kháng ethambutol ở vi khuẩn Mycobacterium tuberculosis tại Việt Nam
embB mutations associated with ethambutol resistance in Mycobacterium tuberculosis isolates in Vietnam
Tác giả: Nguyễn Quang Huy, Vũ Thị Thương, Khiếu Thị Thúy Ngọc, Nguyễn Văn Hưng,
Anne-Laure Banuls, Nguyễn Thị Vân Anh
Tóm tắt:
Ethambutol (EMB) là một trong số thuốc chống lao hàng một đóng vai trò quan trọng trong điều trị bệnh
lao. Nghiên cứu này nhằm xác định đột biến kháng EMB trên gen embB và mối liên quan với các dòng vi
khuẩn Mycobacterium tuberculosis gây bệnh lao. Hai trăm sáu mươi chủng M. tuberculosis, trong đó có
100 chủng kháng EMB được lựa chọn để giải trình tự gen embB xác định đột biến kháng EMB. Phân tích
trình embB tự cho thấy, 91% (91/100) chủng kháng EMB mang ít nhất 1 đột biến kháng EMB và chỉ có
1,3% (2/160) chủng nhạy EMB mang đột biến kháng. Đột biến thường gặp nhất được phát hiện ở codon
embB306 (61%), tiếp theo là codon embB497 (14%) và embB406 (9%). Chẩn đoán phân tử dựa trên đột
biến gen embB đạt độ nhạy 91% và độ đặc hiệu 98,7%. Đột biến trong vi khuẩn dòng Beijing và EAI đa
dạng và tìm thấy cả ở trong và ngoài vùng nóng với tỷ lệ đột biến phổ biến nhất embB306 và embB497 cao
hơn so với dòng Euro-American. Trong khi đột biến ở chủng dòng Euro-American chỉ tìm thấy trong vùng
nóng với tỷ lệ đột biến embB406 cao hơn hai dòng kia. Việc phát hiện vi khuẩn lao kháng EMB có tần suất
đột biến embB cao (91%) là cơ sở quan trọng để ứng dụng công nghệ DNA-chip microarray hoặc giải trình
tự gen phát hiện nhanh M. tuberculosis kháng thuốc.
Summary:
Ethambutol (EMB), a first-line antituberculosis
drug,
plays
a
very
important
role
in
treatment of tuberculosis (TB). This study
aimed to identify embB mutations associated
with EMB resistance and their relation with
Mycobacterium tuberculosis lineages. Two
hundred sixty clinical M. tuberculosis isolates
encompassing 100 EMB-resistant ones were
selected for sequencing of the embB gene.
Results showed that DNA sequencing of embB
gene showed that, 91% (91/100) EMB-resistant
isolates carried at least one mutation associated
with EMB resistance and only 1.3% EMBsusceptible
isolates having EMB-resistance
mutation. The most common mutations were
found at codon embB306 (61%), followed by
codon embB497 (14%) and embB406 (9%).
Overall, embB mutations based molecular
diagnosis can have the sensitivity and specificity
of 91% and 98.7%, respectively. Mutations in
Beijing and EAI isolates were highly diverse
and found both inside and outside hot spot
region of embB gene, with the proportions
of the most frequent mutations at codons
embB306 and embB497 were higher compared
to that of Euro-American isolates. Meanwhile,
mutations in Euro-American isolates were only
found in the hot spot region, and proportion
of embB406 mutations was higher, compared
with Beijing and EAI isolates. This study
underlines a high proportion (90%) of M.
tuberculosis carried embB mutations associated
with EMB resistacance suggesting the potential
application of modern molecular diagnostic
technologies such as DNA chip microarray or
targeted gene sequencing for rapid detection of
drug-resistant strains towards personalized TB
treatment strategy nationwide
Từ khóa:
Mycobacterium tuberculosis, đột biến gen embB, giải trình tự, ethambutol, lao đa kháng thuốc (MDR-TB).
Keywords:
Mycobacterium tuberculosis, embB mutations, sequencing, ethambutol, multidrug resistant tuberculosis (MDR-TB)
File nội dung:
o180419.pdf
Tải file: