Trang: 55
Tập 30, số 3 2020
PHÁT TRIỂN VÀ ĐÁNH GIÁ ĐỘ NHẠY VÀ ĐỘ ĐẶC HIỆU CỦA KỸ THUẬT PCR VÀ LAMP TRONG VIỆC PHÁT HIỆN BURKHOLDERIA PSEUDOMALLEI
EVALUATION OF PCR AND LAMP TECHNIQUES FOR DETECTION OF BURKHOLDERIA PSEUDOMALLEI
Tác giả: Bùi Thị Lan Anh, Phạm Thị Hà Giang, Lê Thị Lan Anh, Võ Viết Cường,
Phạm Việt Hùng, Quế Anh Trâm, Irina Zakharova, Dmitry Viktorov
Tóm tắt:
Trong những năm gần đây, sự ghi nhận các trường hợp bệnh melioidosis, nhiễm trùng phổi do vi khuẩn
Gram (-) B. pseudomallei, gia tăng đáng kể trên thế giới. Điều này được giải thích do sự lây lan bệnh
tăng và các phương pháp chẩn đoán bệnh ngày càng hiện đại, chính xác hơn. Chúng tôi nghiên cứu đề
tài này nhằm phát triển và đánh giá độ nhạy và độ đặc hiệu của hai kỹ thuật PCR, LAMP trong việc phát
hiện Burkholderia pseudomallei. Mồi được thiết kế dựa trên trình tự gen ofr2 thuộc hệ thống tiết type III
(TTSS1). Kỹ thuật PCR và LAMP đã phát hiện được B. pseudomallei phân lập từ chủng lâm sàng với giới
hạn phát hiện là 10 CFU/ml. Đối với các mẫu ADN tách từ chủng vi khuẩn pha với đất, giới hạn phát hiện
của LAMP là 102CFU/ml cao hơn PCR (104CFU/ml). Độ đặc hiệu của PCR và LAMP lần lượt là 100%
và 95%. Trong chẩn đoán melioidosis, PCR có thể hữu ích trong phương pháp khẳng định tại phòng thí
nghiệm, LAMP phù hợp trong sàng lọc nhanh.
Summary:
In recent years, the record of cases of
melioidosis caused by B. pseudomallei has
increased signifcantly in the world. This is
explained by the increased disease spread and
the improvements in accurately and rapidly
detection of pathogen. This study aims to
develop and evaluation two techniques PCR
and LAMP (Loop-Mediated Isothermal
Amplifcation) for detection of Burkholderia
pseudomallei. Primers are designed based on
the sequence ofr2 gene of type III secretion
system (TTSS1). The isolated clinical B.
pseudomallei strains have detected by PCR
and LAMP techniques with a sensitivity of
10 CFU/ml. For DNA samples isolated from
soil-mixed bacteria, the LAMP detection limit
was 102 CFU/ml higher than PCR (104 CFU/
ml). Specifcity of PCR and LAMP are 100%
and 95%, respectively. In the diagnosis of
melioidosis, PCR can be useful in laboratory
confrmatory methods, LAMP is suitable for
rapid screening.
Từ khóa:
Melioidosis; Burkholderia pseudomallei; PCR; LAMP
Keywords:
Melioidosis; Burkholderia pseudomallei; PCR; LAMP
File nội dung:
o200355.pdf
Tải file:
