Thứ bảy, 19/09/2020
 NămSố
 Từ khóa
 Tác giả
Tìm thông tin khác
Thực trạng dinh dưỡng của trẻ em dưới 5 tuổi tại một số quận huyện ở Hà Nội, năm 2019
Những rào cản trong sử dụng dịch vụ y tế và triển khai chương trình chăm sóc sức khỏe cho người dân tộc thiểu số tại một số tỉnh Việt Nam, 2019
Hiệu quả bẫy Gravid Aedes Trap trong giám sát muỗi truyền bệnh sốt xuất huyết dengue tại thành phố Nha Trang, 2018-2019
ads
Trang: 116
Tập 30, số 5 2020

BƯỚC ĐẦU ỨNG DỤNG PHƯƠNG PHÁP GIẢI TRÌNH TỰ GEN THẾ HỆ MỚI TRONG PHÁT HIỆN ĐA TÁC NHÂN Ở TRẺ CÓ TRIỆU CHỨNG TIÊU CHẢY CẤP

APPLICATION OF NEXT GENERATION SEQUENCING FOR DETECTION OF MULTIPLE PATHOGENS IN CHILDREN WITH ACUTE DIARRHEA
Tác giả: Vũ Đình Thiểm, Nguyễn Thị Hiền Anh, Nguyễn Vân Trang, Chử Thị Ngọc Mai, Lê Thị Khánh Ly, Nguyễn Minh Hồng, Đặng Đức Anh, Tessa Braeckman, Jelle Mathijnsense và Piere VanDamme
Tóm tắt:
Bệnh tiêu chảy có tỷ lệ nhiễm và tử vong cao trong nhóm trẻ dưới 5 tuổi, đặc biệt là ở những nước đang phát triển như Việt Nam. Vi rút rota là một tác nhân quan trọng gây tiêu chảy bên cạnh trên 20 tác nhân vi khuẩn, vi rút và ký sinh trùng khác đã được xác định. Tuy nhiên có tới 20% những ca bệnh không xác định được nguyên nhân. Nghiên cứu này nhằm sử dụng phương pháp giải trình tự gen thế hệ mới (Nextgeneration sequencing - NGS) để phát hiện những tác nhân mới trong những ca bệnh tiêu chảy ở trẻ em. Mẫu phân của trẻ uống vắc xin rota mắc tiêu chảy được thu thập và sàng lọc một số tác nhân phổ biến bằng realtime RT-PCR và ELISA. Đồng thời, 3-4 mẫu của trẻ em Việt Nam và Bỉ được trộn lại để phân tích đa tác nhân bằng NGS. 25 và 15 nhóm tác nhân được phát hiện tương ứng ở mẫu bệnh phẩm của trẻ em Việt Nam và Bỉ. Bên cạnh các tác nhân vi rút quen thuộc họ Picornavirdae, Caliciviridae, phương pháp đã phát hiện một số vi rút không thường xuất hiện như vi rút thuộc họ Parvoviridae, một số thực khuẩn thể (bacteriophage) của V.cholera, Samonella trong các ca tiêu chảy ở cả Việt Nam và Bỉ. Như vậy phương pháp giải trình tự gen thế hệ mới có thể dùng để phát hiện đa tác nhân, bao gồm cả các tác nhân tiềm năng.
Summary:
Diarrhea cause high mobidity and mortality in children under 5 years of age, especially for developing countries like Viet Nam. Apart from rotavirus, known to be the most important cause of acute diarrhea in chidren, more than 20 pathogens have been identifed. However, there is still 20% of diarrheal cases with unknown cause worldwide. This study aimed to apply of next generation sequencing for detection of multiple pathogens in children with acute diarrhea. Fecal samples from rotavirus vaccinated chidren were collected and tested for common pathogens by realtime RT-PCR and ELISA. For NGS 3-4 samples were pooled and analysed. Twenty-fve and ffteen groups of pathogens were identifed in fecal samples from Vietnamese and Belgium children. Apart from the members of the Picornavirdae, Caliciviridae family, uncommon members from Parvoviridae, bacteriophage of V. cholera, Samonella were identifed in Vietnam. Thus, NGS could serve as an useful tool to identify multiple pathogens including new pathogens in Vietnam.
Từ khóa:
NGS; tiêu chảy cấp; Việt Nam; Bỉ
Keywords:
Next generation sequencing; acute diarrhea; Vietnam; Belgium
File nội dung:
o2005116.pdf
Tải file:
Tải file với tiền ảo trong tài khoản thành viên.
Thông tin trong cùng số xuất bản:
CHÚC MỪNG NGÀY BÁO CHÍ CÁCH MẠNG VIỆT NAM
Nhân ngày Báo chí cách mạng Việt Nam 21-6, xin kính chúc các đồng nghiệp, chuyên gia bình duyệt và thành viên Ban Biên tập mạnh khỏe, thành công và có nhiều đóng góp cho sự nghiệp Báo chí. GS.TS Đặng Đức Anh (Tổng Biên tập Tạp chí Y học dự phòng)
Website www.tapchiyhocduphong.vn được phát triển bởi đơn vị thiết kế web: OnIP™ (www.onip.vn - mCMS).
log