Trang: 153
Tập 32, số 7 2022
PHÁT HIỆN VÀ XÁC ĐỊNH LOÀI CỦA CRYPTOSPORIDIUM BẰNG PHƯƠNG PHÁP MIỄN DỊCH HUỲNH QUANG (IFA) VÀ PCR GIẢI TRÌNH TỰ TỪ MẪU CHẤT THẢI BIOGAS TẠI TỈNH BẮC GIANG
DETECTION AND SPECIES IDENTIFICATION OF CRYPTOSPORIDIUM BY USING IMMUNOFLUORESCENT ASSAY (IFA) AND PCR SEQUENCING FROM BIOGAS WASTE IN BAC GIANG
Tác giả: Nguyễn Thùy Trâm, Tăng Thị Nga, Lê Thị Trang, Phùng Thị Thu Hằng,
Lê Thanh Hương, Phạm Thanh Hải, Lương Minh Hòa, Đoàn Thu Trà
Tóm tắt:
Mục tiêu của nghiên cứu này là nhằm đánh giá sự khác nhau và hiệu quả của phương pháp IFA và PCR giải
trình tự trong việc xác định sự hiện diện và định danh ở mức độ loài của Cryptosporidium spp. trong mẫu
chất thải biogas. Trong nghiên cứu này, 167 mẫu chất thải biogas được thu thập từ 03 huyện (Việt Yên,
Lạng Giang và Hiệp Hòa) của tỉnh Bắc Giang từ năm 2019 - 2020 để tìm bào nang Cryptosporidium. Có 16
trong số 167 (9,6%) mẫu được phân tích bằng phương pháp miễn dịch huỳnh quang (IFA) dương tính với
Cryptosporidium spp.,. Trong số này 11 mẫu đồng thời được khẳng định dương tính với Cryptosporidium
spp., bằng phương pháp PCR. Các mẫu dương tính với PCR được giải trình tự trên gen 18S rRNA. Cụ thể,
có 4 loài Cryptosporidium scrofarum, 2 C. suis được phát hiện trong mẫu nước thải trước biogas. Có 2 loài
C. scrofarum, 1 C. suis, 1 C. bailey và 1 C. meleagridis được phát hiện trong mẫu nước thải sau biogas. Kết
quả PCR giải trình tự cho thấy các loài Cryptosporidium phân lập được là những loài lây truyền từ động vật
sang người. Chính vì vậy, việc xác định Cryptosporidium spp. bằng phương pháp miễn dịch huỳnh quang,
kết hợp với PCR giải trình tự gen 18S rRNA có ý nghĩa quan trọng trong các nghiên cứu dịch tễ học, điều
tra nguồn gốc của nhiễm trùng và giám sát bệnh tiêu chảy do Cryptosporidium.
Summary:
This study was done to access the
difference and effectiveness of using both
IFA and PCR sequencing methods in species
identification and confirmation of presence of
Cryptosporidium spp. in biogas waste. In this
study, 167 biogas waste samples were collected
from biogas influent and effluent samples in
three communes (Viet Yen, Lang Giang, and
Hiep Hoa) in Bac Giang province frp, 2019
to 2020 to test for Cryptosporidium spp., and
Giardia spp., (oo)cysts. Among these samples,
16 samples analyzed by immunofluorescent
assay showed the presence of Cryptosporidium
spp.,. Of which 11 samples were simultaneously
confirmed by polymerase chain reaction.
Nucleic acid sequencing was done on the 18S
rRNA gene. Four Cryptosporidium scrofarum,
and 2 C. suis were identified in biogas influent
samples. Two C. scrofarum, 1 C. suis, 1 C.
bailey, and 1 C. meleagridis were detected in
biogas effluent samples. The sequencing results
showed that the isolated Cryptosporidium
spp. are zoonotic species. Therefore, the
identification of Cryptosporidium spp. by IFA
and PCR sequencing has important implications
in epidemiological studies, investigation of
infection/contamination origin, or surveillance
of diarrhea caused by Cryptosporidium.
Từ khóa:
Cryptosporidium; Giardia; biogas influent/effluent; IFA; PCR
Keywords:
Cryptosporidium; Giardia; biogas influent/effluent; IFA; PCR
DOI: https://doi.org/10.51403/0868-2836/2022/851
File nội dung:
o2207153.pdf
Tải file:
