Trang: 23

Tập XXIII, số 11 (147) 2013

Dynamic of Norovirus genotype circulating in Vietnam during 2007 - 2013: Emergence and dominance of the new GII.4 ariant whitle conserving human blood group antigen interaction sites

Tác giả: Vũ Thị Bích Hậu, Đặng Đức Anh, Nguyễn Vân Trang

Tóm tắt:
Nghiên cứu giám sát trên hơn 1800 mẫu phân tiêu chảy tại bệnh viện ở một số tỉnh miền Bắc nước ta từ 2007 đến nay cho thấy NV GII.4 là genotype lưu hành phổ biến nhất (74,5%), kế tiếp là genotype GII.3 (20%). Sự biến động đáng kể và nhanh chóng của chủng NV GII.4 trong thời gian ngắn với các đa dạng chủng khác nhau bao gồm: Nhóm 2006b chiếm ưu thế trong những năm 2007-2008 đã dần thay thế bởi nhóm Sydney-2012 trong năm 2013. Genotype GII.4 nhóm New Orleans-2009 tồn tại trong giai đoạn 2010-2012 và không xuất hiện trong năm 2013. Sự khác biệt trình tự axit amin gen capsid VP1 của vi rút giữa các chủng NV GII.4 nhóm 2006b, New Orleans-2009, Sydney 2012 dao động từ 6-9%, tuy vậy amino acid tại các vị trí tương tác với thụ thể kháng nguyên nhóm máu không thay đổi. Tương tự với NV-GII.4, vị trí tương tác với kháng nguyên nhóm máu của các chủng GII.3 ở nước ta từ 2007-2013 có sự ổn định với sự khác biệt trong trình tự axit amin là 3-5% giữa các chủng. Như vậy, cùng một lúc tồn tại sự đa dạng di truyền của 2 genotype NV này nhưng bền vững trong tương tác với tế bào vật chủ. Điều này giải thích khả năng lưu hành trong thời gian dài của 2 genotype này ở nước ta, tương tự với đặc điểm chủng NV lưu hành trên thế giới.

Summary:
Surveillance including approximately 1800 diarrheal samples from 2007 untill present in hospitals of Northern provinces indicates that NV GII.4 remains the most predominant genotype, representing 74.5% of circulating strain, followed by GII.3 genotype (20%). A significant and swift dynamic during the short study period of the GII.4 strains was noted: the GII.4 2006 variant dominated during 2007-2008 has been gradually replaced by the Sydney-2012 variant during 2013. The New Orleans 2010, emerged in 2010, is no longer detected in 2013. Divergence in amino acid sequences of the capsid VP1 gene among the Vietnamese strains of different GII.4 variants, 2006b, New Orleans 2010 and Sydney 2012 ranges from 6-9%, yet amino acid positions at the site of human blood group antigen interaction are highly conserved. Similarly while the variation among GII.3 strains collected in Vietnam (GII.3c cluster) is 3-5%, the interaction site remained unchanged. Thus antigen variation while conserved host interaction site could help explained the dominance of norovirus GII.3 and GII.4 in our population.

Từ khóa:
Norovirus, chủng GII.4, chủng GII.3, kháng nguyên nhóm máu, trẻ em

Keywords:
Norovirus, GII.4 variants, GII.3, human blood group antigen, children

File nội dung:
yhdp_origin23_11_2013.pdf

Tải file:

Tải file với tiền ảo trong tài khoản thành viên.