Trang: 55

Tập XXIII, số 11 (147) 2013

Effectiveness of realtime PCR, multiplex PCR in direct detection of Haemophilus influenzae type B, Streptococcus pneumoniae and Neisseria meninggitidis in cerebrospinal fluid specimen

Tác giả: Phan Lê Thanh Hương, Nguyễn Phong Lan, Đỗ Bích Ngọc, Đặng Đức Anh

Tóm tắt:
Hai kỹ thuật sinh học phân tử (SHPT) là PCR đa mồi thông thường và realtime PCR đơn mồi được áp dụng trên 110 mẫu bệnh phẩm dịch não tủy (DNT) của bệnh nhi được chẩn đoán viêm màng não mủ để phát hiện 3 loại vi khuẩn gây bệnh phổ biến nhất ở trẻ nhỏ (Haemophilus influenzae typ b, Streptococcus pneumoniae và Neisseria meningitidis). Kết quả cho thấy: Kỹ thuật Realtime PCR đã phát hiện được 30 mẫu dương tính với 1 trong 3 loại vi khuẩn (27.27%), PCR đa mồi cho kết quả dương tính ở 31 mẫu DNT (28.18%). PCR đa mồi có cùng kết quả phát hiện với realtime PCR ở 29 mẫu bệnh phẩm. Tuy nhiên, có 3 mẫu DNT cho kết quả khác nhau giữa realtime PCR và PCR đa mồi (2 mẫu dương tính ở PCR đa mồi nhưng âm tính ở realtime PCR; 1 mẫu dương tính ở realtime PCR nhưng âm tính ở PCR đa mồi). Sản phẩm PCR đa mồi đã được giải trình tự và đã khẳng định kết quả thu được của PCR đa mồi là chính xác. Giá trị phát hiện của multiplex PCR phù hợp với realtime PCR ở mức cao (Kappa = 0,93). Vì vậy, với điều kiện ở Việt Nam, có thể sử dụng PCR đa mồi giúp tiết kiệm công sức, sinh phẩm và vẫn đạt hiệu quả trong chẩn đoán 3 tác nhân vi khuẩn phổ biến gây viêm màng não mủ ở trẻ nhỏ, đặc biệt phù hợp với các phòng xét nghiệm vi sinh lâm sàng của các Trung tâm Y tế Dự phòng tỉnh/thành phố hoặc bệnh viện

Summary:
In order to detect one of three common bacterial pathogens causing meningitis in children (Haemophilus influenzae type b, Streptococcus pneumoniae and Neisseria meningitidis), two molecular biological techniques such as multiplex PCR and realtime PCR were applied to 110 cerebrospinal fluid (CSF) specimens that were taken from bacterial meningitis suspected children. The results showed that: 30 CSF specimens were positive with 1 of three target bacteria in realtime PCR (27.27%) and 31 CSF specimens were positive with 1 of three target bacteria in multiplex PCR (28.18%). Multiplex PCR had the same result with realtime PCR in 29 CSF specimens. However, it was different from multiplex PCR and realtime PCR in 3 CSF specimens (2 positive in multiplex PCR/ monoplex PCR and negative in realtime PCR; 1 positive in realtime PCR but negative in multiplex PCR). Sequencing products of multiplex PCR was done and the results of sequencing confirmed accuracy of multiplex PCR. Detective value of the multiplex PCR is correspondence with realtime PCR at high level (Kappa = 0,93). Therefore, multiplex PCR for detection of bacterial pathogens causing meningitis in children can be applied in Vietnam, especially multiplex PCR is suitable for microbiology department of Provincial Preventive Medicine Centers or Provincial Hospitals, because this technique is not only saving money, labor but also effectiveness.

Từ khóa:
Sinh học phân tử (SHPT), PC đa mồi, realtime PCR, dịch não tủy, viêm màng não mủ, vi khuẩn Haemophilus influenzae type b, Streptococcus pneumoniae, Neisseria meningitidis

Keywords:
molecular biological technique, multiplex PCR, realtime PCR, bacterial meningitis, cerebrospinal fluid, Haemophilus influenzae type b, Streptococcus pneumoniae and Neisseria meningitidis.

File nội dung:
yhdp_origin55_11_2013.pdf

Tải file:

Tải file với tiền ảo trong tài khoản thành viên.