Trang: 107

Tập XXVI, số 10 (183) 2016

Genetic characterization of HA and NA gene of seasonal influenza viruses caused severe viral pneumonia in patient admitted hospitals, Northern Vietnam 2013-2015

Tác giả: Hoàng Vũ Mai Phương, Lê Thị Thanh, Nguyễn Cơ Thạch, Ứng Thị Hồng Trang, Vương Đức Cường, Phạm Thị Hiền, Nguyễn Phương Anh, Trần Thu Hương, Hoàng Thu Hương, Nguyễn Vũ Sơn, Phạm Thị Thu Hằng, Nguyễn Lê Khánh Hằng

Tóm tắt:
Vi rút cúm là một trong những tác nhân chính gây hội chứng cúm và viêm đường hô hấp cấp tính nặng. Nghiên cứu thực hiện xác định đặc điểm di truyền học của vi rút cúm mùa trên các bệnh nhân viêm phổi nặng nghi do vi rút thu thập tại một số bệnh viện ở miền Bắc Việt Nam, 2013-2015. Xét nghiệm RT-PCR 601 mẫu bệnh phẩm dịch họng và dịch nội khí quản cho kết quả dương tính 31,9%, trong đó 19,1% A/ H3N2, 8,5% A/H1N1pdm09 và 4,3% cúm B. Các mẫu dương tính RT-PCR có tỉ lệ phân lập trên tế bào MDCK đạt 66%. Cây phát sinh chủng loại HAH3 cho thấy các vi rút trong năm 2013 thuộc nhóm 3C.3b, năm 2014 tập trung trong nhóm 3C.3a, nhóm 3C.2a lưu hành nổi trội tại Việt Nam năm 2015. Phân đoạn gen HA1-H3 biến đổi nhanh hơn HA-H1pdm09, các vi rút lưu hành cuối năm 2015 có biểu hiện giảm độ tương đồng với chủng văc-xin mùa cúm 2015-2016 (A/Switzerland/9715293/2013). Cây phát sinh chủng loại phân đoạn gen HA vi rút A/H1N1pdm09 năm 2013 thuộc nhóm 6C, năm 2014 thuộc nhóm 6B. Các protein NA của vi rút cúm A không mang đột biến liên quan đến giảm độ nhạy cảm của vi rút cúm với thuốc kháng vi rút. Vi rút cúm B gây viêm phổi nặng năm 2013-2014 thuộc hai dòng B/Victoria và B/Yamagata, năm 2015 thuộc dòng B/Yamagata, tương đồng với các chủng văc-xin cho các mùa cúm từ 2013-2015.

Summary:
Influenza virus is the most common pathogen cause influenza like illness and severe acute respiratory infections. The aim of the studyis to identify the genetic characteristics of seasonal influenza virus in severe viral pneumonia patientsadmitted to hospitals in the North Vietnam, 2013-2015. Total 601 specimens were tested RT-PCR for influenza and showed 31.9% positive, among them 19.1%, 8.5% and 4.3% were positive for A/H3N2 A/H1N1pdm09 and influenza B respectively. All positive RT-PCR samples were isolated on MDCK cell reached 66%. The phylogenetic tree of HAH3 showed that virus isolated in 2013 and 2014 clustered in to group 3C.3b and 3C.3a; group 3C.2a was dominant in Vietnam in 2015. The identity between A/H3N2 circulated in the second half of 2015 and vaccine strain for the season 2015- 2016 (A/Switzerland/9715293/2013) were decreased suggested that HAH3 has evolved faster than other subtypes. Hemagglutinin of A/ H1N1pdm09 gathered in group 6C and 6B in 2013 and 2014. The NA protein of influenza A viruses did not carry the mutations that confer the reduction of susceptibility of influenza virus to antivirals. Influenza B Victoria lineage viruses cause severe pneumonia in 2013- 2014 while B/Yamagata lineage dominated in 2015, both circulated lineages in Vietnam were closely related to vaccine strains for the influenza seasons from 2013 to 2015.

Từ khóa:
Viêm phổi nặng, cúm mùa, phân đoạn gen HA và NA

Keywords:
severe acute respiratory infection, seasonal influenza, HA and NA gene

File nội dung:
O1610107.pdf

Tải file:

Tải file với tiền ảo trong tài khoản thành viên.