Trang: 60
Tập 32, số 7 2022
SỰ TÁI NỔI KIỂU GEN VI RÚT ROTA G1P[8] Ở NAM ĐỊNH NĂM 2020 - 2021 KHÔNG CÓ NGUỒN GỐC TỪ VẮC XIN
RE-EMERGENCE OF ROTAVIRUS G1P[8] WHICH WAS GENETICALLY UNRELATED TO VACCINE-DERIVED STRAIN IN NAM DINH PROVINCE, 2020 - 2021
Tác giả: Phạm Thị Phương Thảo, Lê Thị Khánh Ly, Chử Thị Ngọc Mai, Lại Tuấn Anh,
Lê Thị Phương Mai, Nguyễn Tự Quyết, Vũ Đình Thiểm, Nguyễn Đăng Hiền,
Nguyễn Thuý Hường, Đặng Đức Anh, Nguyễn Vân Trang
Tóm tắt:
Vi rút Rota G1P[8] là một trong các kiểu gen phổ biến trên thế giới. Cho đến 2013 chủng G1P[8] có tỷ lệ
lưu hành cao nhất trước khi chủng G3 trở nên phổ biến từ 2015 - 2016. Ba vắc xin phòng vi rút Rota cấp
phép tại Việt Nam đều là vắc xin sống, giảm độc lực, chứa thành phần G1 và P[8]. Nghiên cứu này nhằm
theo dõi sự lưu hành của kiểu gen G1P[8] từ 2016 - 2021 và đánh giá mối liên quan giữa việc tái xuất hiện
của kiểu gen này với việc sử dụng vắc xin Rotavin-M1 ở tỉnh Nam Định. Bằng phương pháp RT-PCR với
mồi đặc hiệu, chúng tôi phát hiện kiểu gen G1P[8] với tỷ lệ cao 23,2% từ 6/2020 - 5/2021 sau 4 năm hiếm
gặp (tỷ lệ phát hiện 0 - 2,4%). Phân tích độ tương đồng trình tự gen VP4 (876bp) và VP7 (1062bp) và cây
phát sinh chủng loại cho thấy các chủng phát hiện được ở thời điểm này thuộc GI-dòng II và P[8] - dòng
III, khác với chủng vắc xin Rotavin-M1, Rotarix và Rotateq. Các chủng này khác biệt 2 - 3 axit amin với
Rotavin-M1 và Rotateq trong vùng gen VP7; khác 2 - 4 axit amin với Rotavin-M1 và Rotarix trong vùng gen
VP4. Kết quả cho thấy chủng G1P[8] đang phổ biến ở Nam Định không có nguồn gốc từ vắc xin. Cần tiếp
tục theo dõi sự lưu hành của kiểu gen G1P[8] này trong tương lai.
Summary:
Rotavirus G1P[8] is one of predominant
rotavirus genotypes worldwide. Until 2013, the
G1P[8] genotype was still the most dominant;
later was dominated by the G3 genotype from
2015-2016. The 3 live attenuated vaccines
licensed in Vietnam all contain G1 and P[8]
components. This study aims to monitor G1P[8]
circulation during 2016-2021 and evaluate the
relationship between the increased prevalence
of this genotype with the pilot implementation
of Rotavin-M1 in Nam dinh province. Using
RT-PCR with specific primers, we showed a
re-emergence of G1P[8] strains with a high
frequency (23.2%) in Nam Dinh from 6/2020-
5/2021, after 4 years with a low prevalence
(0% - 2.4%, annually). Nucleotide/amino acid
sequence comparison and phylogenetic tree
analysis indicated that the currently circulating
strains belong to G1-lineage II and P[8]-
lineage III, different from Rotavin-M1 vaccine
(G1-lineage I, P[8]-lineage II), Rotarix vaccine
(G1-lineage II, P[8]-lineage I) and Rotateq
vaccine (G1-lineage III), P[8]-lineage II)
strains. These strains exhibited 2 - 3 variations
in amino acid sequences compared to those of
Rotavin-M1 and Rotateq in the VP7 gene and
2 - 4 variations compared to Rotavin-M1 and
Rotarix in the VP4 gene. These results showed
the genotype G1P[8] that recently became
common in Nam Dinh could not be derived
from the rotavirus vaccine strains. Further
monitoring the circulation of this G1P[8] strain
should be continued in the future.
Từ khóa:
Rotavirus; G1P[8]; vi rút rota có nguồn gốc vắc xin
Keywords:
Rotavirus; G1P[8]; vaccinederived rotavirus strains
DOI: https://doi.org/10.51403/0868-2836/2022/842
File nội dung:
o220760.pdf
Tải file:
